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This article is translated from the original article "Bioinformation as a business venture and the rise of bioinformatics",
Hwa A. Lim.
The Translation was by Computing Services, New York.

生物學相關信息
的商品化及生物信息學的興起(下)

首屆國際生物信息學大會是由作者組織並主持的，得到了哥倫比亞大學醫學院院長 Charles R. Cantor 教授，佛羅里達州大學超級計算機計算研究所所長 Joseph E. Lannutti 教授的幫助。首屆國際電泳、超級計算和人類染色體大會 1990 年 4 月 10 日 -13 日在 Tallahassee 佛羅里達州會議中心召開。儘管會議的標中沒有包含 “ 生物信息學 ” 這個詞，但它是這次會議的一個重要組成部分。出席會議的知名人士有： Charles DeLisi (波士頓大學工程學院院長 ) ， Charles Cantor (當時 Lawrence Berkeley 國家實驗室染色體項目負責人 ) ， George Bell ( 當時 Los Alamos 國家實驗室染色體項目執行主席 ) ， Anthony Carrano (Lawrence Livermore 國家實驗室染色體項目負責人 ) ， Temple Smith (哈佛醫學院 Dana Farber 癌症中心主席 ) ， Alexandar Bayev (當時俄羅斯染色體項目主席 ) 等，共有 120 人參加了該會議。會議是由美國能源部、佛羅里達科技研究與發展局、 Thinking Machine 機器集團、電子設備集團、 CRAY 研究公司等出資的，有關會議過程的書本已編輯 (35) 。資助者大多為聯邦或州的政府機構或有通用電腦公司。

8.2 隨後的幾年

這一系列會議在持續， 1992 年 6 月 4 日至 7 日，第二屆國際生物信息學，超級計算機和複雜基因會議又在佛羅里達聖彼德堡海灘 Trade Winds 賓館召開，前蘇聯的解體逼使林華安在七個月內確定另一計劃，之所以選擇聖彼得堡，部分歸因於它的地理位置，部分因為它的名字 ( 就像俄羅斯的聖彼得堡 ) 。全世界有十三多個國家參加了這次會議。這次會議部分由英特爾公司、 MarPar 電腦公司、世界科學出版社、 Silicon Graphics 公司、科技研究與發展局、美國能源部、美國國家科學基金會出資，會議文集第二次編輯成書 (36) ，把這個學科領域展現在當時還相對很小的團體面前。
第三次會議， “ 第三屆國際生物信息學和基因組研究會議 ” ， 1994 年 6 月 1 日至 4 日在佛羅里達 Tallahassee 的 Augustus Turnbull III 佛羅里達州會議中心召開。該會議由 Compugen 有限公司， Eli Lilly 公司， MasPar 電腦公司，世界科技出版公司， Pergamon 出版社，美國能源部，美國國家科學基金會，美國國家健康研究所，國際科學基金部分資助。會議過程收錄在一本書中 (37) ，值得注意的一點是，資助者是聯邦，州和國際機構，特殊用途電腦公司，製藥公司和出版社。

8.3 生物信息學會議
走向商業化及上網

第三次會議後不久，聯邦和州機構迸入了精簡和提高效率的階段， CHI 和作者決定使系列會議商業化。這二年一次一次的系列會議， 1994 年由劍橋健康技術研究所 (CHI ，網址： http://www.healthtech.com) 接管，因為這一學科領域的逐漸流行， CHI 打算將這一系列會議改為一年一次。 “ 第四屆國際生物信息學和基因研究會議 ” 1995 年 6 月 5 日至 7 日在三藩市的 Nikko 賓館召開，因為版權問題，該會議沒有編輯會議過程。 “ 第五屆國際生物信息學和染色體研究會議 ” 1996 年 6 月 10 日至 11 日就在巴爾的摩內港賓館召開，會議提交的一些論文由 Gene-Combis ( 一家上網的出版公司 ) 出版。第六屆會議 1997 年 6 月 11 日至 12 日在三藩市的 Fairmont 賓館召開。第七屆會議 1998 年 6 月 15 日至 16 日在波士頓的 Copley Plaza 飯店召開。第八屆會議於 1999 年 6 月 14 日至 15 日在三藩市 Nikko 飯店召開。值得注意的一點是儘管前三次會議的參加人數被限制在 150 人以下，但在第五次會議上，參加人數已穩步升至 500 人，充分說明這一學科領域有了越來越高的聲望。
第一次召開有關生物學相關工作電視電話會議的榮譽應給予分生物學情報系統，該會在 1994 年舉行。最近已經有了無數的因特網課程，包括 “ 因特網生物學家 ” (38) ，林華安是創建顧問。現在，在因特爾搜索 “ 生物信息學 ” 這個詞， Alta Vista 搜索引擎找到 150,000 個有關資料 (39).

8.4 相關出版物及會議

為公正評判這個領域，必須提到下列相關的書籍 (40-46) ，也有關於生物信息學的很好的網址，它們中較著名的有：特拉維夫大學 (47) ，華盛頓大學 (48) ， Bielefeld 大學 (49) 。這個目錄並不是全部，還有許多相關的會議，研討會等，其中有分子生物學情報系統；希爾頓高級會；世界電腦醫藥，生及生物科技會議；德國生物信息學會議；分子生物學綜合方法會議，及其它。看起來生物信息學及基因組研究系列會議將會持續多年。
我們也要提到環太平洋和德國有關生物信息學的活動，儘管生物信息學始於美國，德國在生物信息學方面的努力始於幾年後的 1993 年，但似乎德國在言一學科領域做得比美國多得多。近來，德國政府斥資 16,000,000 美元發展該項目。最近結束的第一屆德國國際生物信息學會議起了一個非常好的開端。

9. 基因公司作為服務性公司

許多基因公司有著獨有的，高處理量高成本效益的科技以進行排序或收集生物學相數據，但是，正如表 1 所示，數據是不具有商業效益的，但信息是的。這樣自然而然就形成了一個生物信息學或生物學相關數據觀念上的流程圖，如圖 2 所示。提到物理設計，有關數據庫如圖 3 所示。

表 1 數據和信息的比較

數據信息
儲存起來的事實表達出來的事實
不活躍 ( 存在 ) 活躍 ( 能幫助作決定 )
技術為基礎商業為基礎
從不同的來源獲得從數據轉化而來

圖 2 ：生物數據的示例流程圖

生物數據
生物信息
生物知識
新一代的基因科學

圖 3 ：生物數據用各種數據庫的形式例的流程圖

數據庫
生物數據庫
知識庫
新的發明

圖 4 表明生物信息學通過以下三點來左右決策過程
1) 支持大規模排序，應用自有的高輸出的排序技術。
2) 應用排序獲得數據，諸如克隆信號、基因等。
3) 保持和運行一個獨特的數據庫知識庫。

圖 4 使用生物信息學使目前的排序技術商業化的流程：

高輸出的排序技術
生物信息學
基因數據庫 / 知識庫
商業化

為使得這種方案能成功，一個可能的戰略計劃如圖 5 所示。

10. 生物信息學
的目標和任務

       生物信息學的主要任務包括：
       1. 加強合作，加速基於基因的藥物研究和藥物基因信息的確認。
       2. 確認緣於排序的藥物基因交互式研究
       3. 對已有的染色體信息進行進一步的分析
       4. 確定哪些信息是需要的，那些是過時的
       5. 使上述信息盡快轉化為生產力。
       生物息學的目標和任務根據不同情況的需要會產生變化。

11. 生物信息學和計算機技術

由於生物信息學是生物學和生物學相關信息同計算機技術的結合，因此它的研究必須與計算機技術的發展，尤其是因特網技術的發展同步。因特網的前身是運用於軍事的小規模計算機網絡 ARPANET 。 ARPANET 雖然在某種程度上的多餘的，但它所提供的思路是富有極強生命力的，那就是無論計算機建立於何種平台之上，計算機與計算機之間都可以進行信息交流。
因特網使生物信息和生物知識得到了及時的傳播。在網上有數不勝數的關於生物學的電子出版物。這些資料通過標準 ASC II 碼、 Java 語言和超文本等形式展現在人們眼前。

12. 中國和生物信息學

1978 年以來，中國所經歷的，是一場經濟的奇。在這 20 年裏中國人民創造了世界上最具活力的市場經濟。中國在經濟、生物科學和資訊工業的發展為生物信息學的發展打下了良好的基礎。中國的生物信息學產業有很好的前景 (54) 。

12.1 中國的經濟奇蹟

中國的經濟改革是一項偉大的成功，它比任何人一開始所夢想的還要遠遠輝煌得多。過去二十年的年民經濟增長率達到前所未有的 10% 。 1997 年，中國的進出口總額達到 3250 億美元，在世界貿易最成功的國家中排名第九位， 1997 年香港回歸後其貿易盈餘達到 403 億美元，成為世界第四貿易大國，僅次於美國、日本和德國 (55) 。
經濟合作與發展組織 (OECD) 預言，到 2015 年，中國將會超過美國，成為世界上貨物和公共設施的最大購買者，作為這個樂觀構想的証據，中國人民的勤勉顯然是一個至關重要的因素，同樣，中國相對較高的教育水平和令人羨慕的國家儲備計劃也非常重要，中國的國家儲蓄占國民生產總值的 35%-40% 高於大部分西方國家的兩倍， 1997 年世界銀行報告羅列出中國的實力，它的高儲蓄率，注重實效的經濟改革，相對的穩定，受過教育訓練有素的勞動力和不斷增長的管理能力。

12.2 中國的一些變化
創造了新的機會

中國在投資界獨一無二是因為它商業家們已經經受住了 1997 。 1998 年的亞洲金融危機 (56) ，世行和國際貨幣基金會 (IMF) 把這點歸功於中國完好的經濟基礎和改革政策。中國的一些變化創造了新的機會。

12.2.1 中國的新藥品分類

1985 年，中國衛生部提出了加速發展新的一類藥品分類的標準化辦法 (57) ，稱為 “ 中國新藥類別 2 ” ，該辦法建立在中國傳統藥劑的基礎上。中藥為獲得這一分類的資格，必需提出有效成分，降低無關物質和不純度。這種分類的好處是原先為批准一種新藥而進行的許多耗時、昂貴的臨床前試驗不再需要，重要的是，藥品生產的一慣性和藥品分類有著雙重目的： 1) 推動產業向純淨科技發展， 2) 推動中國傳統醫藥。

12.2.2 保護專利權

1993 年中國通過了專利權保護辦法，根據這個新辦法，新藥的專利保護也成為可能，對中國市場的弄潮兒而言，也具有強大的吸引力。這些變化 ( 分類和保護專利權 ) 使得至少 12 家國際醫藥公司和生物技術公司在中國投資 11 億美元以上，雇用職員超過 10000 人，包括世界上十家最著名的醫藥公司。

12.2.3 吸納人才和信息基礎設施

吸納人才在中國並不是一個難題，因為中國的確擁有一個很好的科技人員人才庫，但生物信息，精密軟件，國際互聯網和局域網等能力卻很難具備。目前最大的挑戰之一是高級商業人 (58) ，首先要招聘本國人才，移居的辦法 ( 即招聘外籍人員移居到中國 ) 花費巨大，可能也不是中國建立強大商業的最好途徑，中國有許多科學家在國內完成大學學業後到美國或歐洲繼續深造，近來，這些科學家有許多不願回國，因為他們錯誤地認為在中國發展事業的機會不多。

12.3 深圳

經濟特區是在 80 年代早期試驗性的政策下建立的，指的是在一些沿海小區域實行開放政策，香港是自由貿易政策下的典型縮影，因為戰略上毗鄰香港，深圳也許是所有特區中最成功的，在深圳，廣東的第二大城市，消費者有著全中國最高收入，年平均 3900 美元 (59-61) 。深圳商業獲得成功機遇顯而易見的。
最近，深圳創下了一些紀錄，注入外資達到一個新的高度 24.22 億美元，比去年增加 39.59%(62) ，至今，深圳有 18000 家運轉企業。深圳重在推行高科產業，如電視機、電腦硬件、電腦軟件、網絡設備等對生物技術業和生物信息業都非常重要，寬鬆的經濟氣氛，益於生產力的發展，導致合資源企業的復甦，深圳市 96 註冊的企業有 52.95% 是合資企業。深圳市的生物工程基礎研究雖然薄弱，但產業化發展較快，其優勢在於靈活的市場機制、對外交流的方便及較為充足的資金投入。今年市政府又及時支持建立了 “ 生化工程中心 ” 具備了適當的產業化能力。

12.4 生物工程學中心和基因中心

中國有兩個人類基因組中心，一個在北京，一個在上海，此外，上海還有一個水稻基因中心。生物信息學工程學設在北大 (63) 和香港中文大學 (64) 。中國正為這一事業投入巨大的努力。
中國政府相當重視生物科技的發展，推出了一系列的生物新藥重點攻關項目，中國在人類基因項目中，也取得了相當大的進展，如最近上海國家人類基因組南方研究中心公布，該中心已找到三百條人類全長的基因，這是世界首次獲得的新基因，按功能分為八類，這次發展對深入揭示功能，了解多些疾病機率，找出基因治療方法及開發有關新藥打下了良好的基礎，上海國家幅射加速器建成後，將更進一步促進這方面的發展。然而，對生物信息學的發展資金和人材的投入還應進一步加強，這是中國可能集中力量，攻關突破走到世界前列的領域。

13. 討論和結論

       從目前國家開支傾向，衛生保健和社會改革來看，生物信息學、疾病數據庫保持，從這些數據庫中得出知識的情報軟件將極有可能對未來的生物醫學起到主要的作用。
       當前成功的治療學以初始的病源為目標，如會傳染疾病的微生物等，或者以多步驟的複雜疾病過程中的一步為目標，治療術的介入，藥品的開發工作都應針對疾病過程本身的分子活動，目前還存在許多技術上的限制：
       1) 低效率 cDNA 的排序
       2) 排序的昂貴開發
       3) 細胞中測 mRNA 的量很困難，有關陳述不完整
       儘管許多公司和研究中心正在發展高生產量，划算的技術，但我們更應該注重數據而不是猜測。傳統的辦法注重認明目標、隔離目標，使目標純淨化，並確定目標所帶來的後果和立體結構，應用合理的藥品的設計、分子模型、合成、篩選以及評價化學化合物，進行臨床試驗和 FDA 驗証。生物信息學提出了一系列未來前景。
       人類的所有的知識總量現在每五年就會翻一倍，在二十世紀八十年代，科學家們花了九年的時間來確定引起 “ 纖維變性囊腫 ” 病的基因。 1997 年，科學家們只用了九天就找到了可能造成帕爾金森氏病的基因的位置。十年內， “ 基因切片 ” 技術將為終身防治基因病提供一條新的道路。生物信息學得了普遍的認可 (65, 66) 。生物信息學前途無量。

後記 1 ：回想

土地革命始於亞洲，持續了成千上萬年，在歐洲結束，工業革命始於歐洲，持續了兩個世紀 (18 世紀 60 年代 -20 世紀 50 年代 ) ，其中 90 年在美國 (19 世紀 60 年代 20 年紀年代 ) ，歷史給了我們兩大重要的教訓 (30) ：
在連續的革命中，每次革命的時間跨度都遠遠少於前一次。每次革命在世界某地區開始，並不意味著就在同一地結束，確實，歷史上沒有一次革命是在它開始的同一地方結束的，信息革命始於幾十年前的美國，它是否會在美國達到頂峰呢？只有時間能証明。

後記 2 ：信息比金錢更值錢的証明

       假如你有十美元，我也有十美元，你把你的十美元給我，我把我的十美元給你，我們仍將各自擁有十美元，這似乎是 “ 金錢守恒 ” 。
       假如我們各自有一個主意，你把你的主意給我，我把我的主意給你，我們就會各自擁有兩個主意，這樣，主意增值，其數目也增加了。
       這樣主意可傳播，主意的數目會倍增，因而在一個信息或知識轉換中，轉換的籌碼倍增，轉換的參與者都贏了。我們已經進入了一個非常的時代，信息時代，在此時代中，更重要的不是你製造了什麼，而是你懂得什麼，資訊和知識是關鍵。

關於作者

林華安 (Hwa A. Lim) 生於馬來西亞，後加入美國籍，他在美國獲得了哲學博士學位、文科碩士學位和工商管理碩士學位，在英國獲得了理學士學位和 ARCS 學位。 1997 年，他創建了 D'Trends ，一家以軟件和數據單元起步的公司，服務於生物技術和衛生保健。此前，他還是 Pangea Systems 科技公司的副總裁 ( 1996-1997) ， Hyseq 公司的生物工程學負責人 (1995-1996) 。佛羅里達州大學超級計算機計算研究所的成員和項目經理 (1987-1995) ，他參加了兩個不同的項目，這些項目均獲得了諾貝爾獎，編輯了八本書，並且是許多國際會議上受歡迎的主題基調發言人，他創造了 “ 生物信息學 ” 這一詞，發起了首屆生物信息學系列會議，並因此受到推崇，除了他科學方面的背景外，他還在金融和發展國際戰略性市聯盟方面有著極豐富的經驗。目前，他也是聯合國生物信息學專家，美國國家科學基金會 ( 電腦信息科學和工程 ) 和美國國家癌症研究所 ( 抗愛滋病，抗癌數據單元；乳腺癌，結腸癌登記；為癌症分子分析提供新技術 ) 的專題評論員。

李大西博士，美國利曼兄弟公司 (Lehman Brothers Inc.) 助理副總裁，國際華人科技工商協會創會主席和現任主席。李大西出生於中國廣東省，在中國獲碩士學位後，於美國獲哲學博士學位。曾在加拿大、美國大學歷任研究員和助理教授，從事高能量物理理論研究。 1992 年以後轉向金融領域。研究金融理論，人工智能在金融的應用等，曾任所羅門兄弟公司 (Solomon Brothers) 高級分析員。現利曼兄弟公司助理副總裁。作為國際華人科技工商協會主席，他積極推動國際經濟科技交流，為科技與工商搭橋，為中國建設和改革提建議。